Verska slika zemlje složena je i geografski podeljena: islam je zastupljeniji na severu, dok na jugu živi veliki broj hrišćana. U pojedinim centralnim oblastima zajednice različitih veroispovesti žive jedne pored drugih, a sukobi oko zemlje, vode, političkog uticaja i bezbednosti često se prepliću sa verskim i etničkim podelama.
Nigerija se već godinama suočava sa ozbiljnom bezbednosnom krizom. Na severoistoku deluju islamističke ekstremističke organizacije Boko Haram i Islamska država Zapadna Afrika (ISWAP), koje izvode napade, otimaju civile i ugrožavaju verske zajednice. Na severozapadu su česte otmice radi otkupnine i napadi na sela, dok se u centralnim delovima zemlje sukobi između stočara i poljoprivrednika često završavaju smrću i raseljavanjem stanovništva.
Verska pripadnost u pojedinim sukobima ima važnu ulogu, posebno kada su na jednoj strani pretežno muslimanski stočari, a na drugoj hrišćanski zemljoradnici. Ipak, uzroke nasilja nije moguće svesti samo na verske razlike: sporovi oko zemlje i vode, siromaštvo, klimatske promene, etničke tenzije i slaba kontrola nad pojedinim oblastima dodatno podstiču sukobe. Nasilju su izloženi i hrišćani i muslimani, a pojedine ekstremističke grupe napadaju i pripadnike sopstvene vere koje smatraju protivnicima.
Prema izveštaju američke Komisije za međunarodnu versku slobodu iz 2026. godine, nasilje povezano sa verskim ekstremizmom, etničkim i ekonomskim tenzijama odnelo je desetine hiljada života od 2009. godine i primoralo veliki broj ljudi da napuste svoje domove. Kriza u Nigeriji tako ostaje jedan od složenijih bezbednosnih problema Afrike, u kojem se prepliću verska pripadnost, borba za resurse i dugogodišnja nestabilnost.
